天福国家湿地公园保护管理中心下设：

发展改革和资产管理科：负责内部监察审计、农经管理、农村产权制度改革、集体资产管理、富民增收、扶贫、帮贫及小额贷款、集体资产方面的安全生产、消防及相关信访稳定等工作。分管乡村振兴、昆山市花桥强村富民联合发展有限公司。

农业生产管理科：负责全区农业生产、农业规划、高标准农田建设、闲置地整治、农业方面的安全生产、消防及相关信访稳定工作、中心系统的防汛防旱、防灾抗灾、应急管理、食品安全等工作。分管人居环境整治、协助分管昆山市花桥国际商务城现代农业发展有限公司。

湿地保护管理科：负责生态旅游、森林防火、志愿者服务、信息化建设、垃圾分类，湿地方面环境整治、安全生产、应急管理及相关信访稳定工作，“美丽昆山”、文明城市等相关创建工作。天福区域内的保洁、保安、保绿、零星工程建设及维修，配合做好长三角一体化发展等工作。